103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36476 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  100 
 
 
520 aa  1079    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  27.08 
 
 
547 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  25.85 
 
 
743 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25.97 
 
 
778 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.82 
 
 
341 aa  96.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.7 
 
 
784 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.98 
 
 
1848 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.96 
 
 
818 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  25.97 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  27.05 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  25.65 
 
 
776 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  26.75 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.61 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.95 
 
 
561 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  24.12 
 
 
579 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  25.06 
 
 
2082 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  24.11 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  24.93 
 
 
792 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  31.28 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.58 
 
 
821 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25.76 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.37 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  26.44 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.11 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  25.84 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.83 
 
 
1147 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.34 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.93 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.21 
 
 
726 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  24.4 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.67 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  24.72 
 
 
783 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  23.34 
 
 
533 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.41 
 
 
563 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  23.98 
 
 
643 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  25.44 
 
 
900 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.72 
 
 
555 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.21 
 
 
570 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.28 
 
 
837 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.14 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  21.17 
 
 
911 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.25 
 
 
567 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  26.45 
 
 
560 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.65 
 
 
558 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  24.59 
 
 
714 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.39 
 
 
535 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.96 
 
 
1919 aa  63.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  33.08 
 
 
727 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  24.06 
 
 
737 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  27.98 
 
 
590 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 
593 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  24.25 
 
 
577 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  23.76 
 
 
717 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  31.97 
 
 
403 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.21 
 
 
551 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  24.95 
 
 
1187 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  27.23 
 
 
681 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  25.75 
 
 
554 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.28 
 
 
706 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
447 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.64 
 
 
371 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  27.85 
 
 
491 aa  57  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 
518 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  29.79 
 
 
1312 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  23.87 
 
 
1207 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.14 
 
 
326 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.36 
 
 
618 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  25.46 
 
 
544 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  25.49 
 
 
566 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.71 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  34.84 
 
 
332 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.44 
 
 
469 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.34 
 
 
375 aa  54.3  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  30.32 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  22.25 
 
 
728 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  23.13 
 
 
787 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  31.91 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  23.32 
 
 
657 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.3 
 
 
941 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  28.36 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.63 
 
 
817 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  25.86 
 
 
547 aa  50.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.19 
 
 
1222 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  33.53 
 
 
558 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.47 
 
 
209 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.45 
 
 
1126 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32200  predicted protein  27.91 
 
 
220 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.457175 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28.06 
 
 
394 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  21.77 
 
 
807 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.17 
 
 
1679 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  38.54 
 
 
450 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  25.06 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.29 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15387  predicted protein  29.17 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0420913  normal  0.0983623 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 
1365 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.67 
 
 
835 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  27.07 
 
 
1448 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  28.21 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  31.01 
 
 
787 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>