43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3336 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  100 
 
 		 787 aa  1616    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.01 
 
 		 1126 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.8 
 
 		 821 aa  86.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.72 
 
 		 1919 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.77 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.42 
 
 		 743 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 2082 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.03 
 
 		 593 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.25 
 
 		 1679 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.34 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.34 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.9 
 
 		 1129 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.25 
 
 		 717 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  26.05 
 
 		 911 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  27.48 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.38 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.81 
 
 		 807 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.39 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.46 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.8 
 
 		 1848 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.36 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.51 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.62 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  23.22 
 
 		 792 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.84 
 
 		 618 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.92 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  27.32 
 
 		 778 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28 
 
 		 394 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.26 
 
 		 706 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  27.27 
 
 		 375 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.1 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  25.81 
 
 		 776 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.83 
 
 		 597 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  28.08 
 
 		 784 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  23.86 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.09 
 
 		 556 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  23.96 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  25.09 
 
 		 558 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.14 
 
 		 1207 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  31.01 
 
 		 520 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>