156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1055 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 		 717 aa  1383    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  82.74 
 
 		 714 aa  1030    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.97 
 
 		 821 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.33 
 
 		 818 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  39.22 
 
 		 911 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.83 
 
 		 784 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.08 
 
 		 778 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.09 
 
 		 792 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.49 
 
 		 2082 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  39.83 
 
 		 776 aa  379  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.58 
 
 		 837 aa  363  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  34.49 
 
 		 743 aa  350  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.11 
 
 		 807 aa  310  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.16 
 
 		 1126 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.96 
 
 		 1919 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  41.81 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.95 
 
 		 1222 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.29 
 
 		 1679 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  38.31 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  42.55 
 
 		 560 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.2 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.39 
 
 		 561 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.57 
 
 		 1129 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.23 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  39.42 
 
 		 579 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.64 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.5 
 
 		 555 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  39.42 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 449 aa  195  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  39.47 
 
 		 546 aa  194  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28.3 
 
 		 1207 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.19 
 
 		 567 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  38.03 
 
 		 558 aa  188  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.05 
 
 		 569 aa  187  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  39.84 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.66 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  28.48 
 
 		 1187 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  36.27 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.34 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  39.43 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  34.02 
 
 		 363 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  34.02 
 
 		 363 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.31 
 
 		 1848 aa  174  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.83 
 
 		 555 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  37.05 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.18 
 
 		 835 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.12 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.63 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  42.94 
 
 		 681 aa  168  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  39.56 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.87 
 
 		 417 aa  167  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.58 
 
 		 921 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.2 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.52 
 
 		 593 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.73 
 
 		 558 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.36 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  38.11 
 
 		 376 aa  151  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.16 
 
 		 810 aa  147  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  33.14 
 
 		 443 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.04 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  38.72 
 
 		 566 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.61 
 
 		 900 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.45 
 
 		 737 aa  137  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.19 
 
 		 692 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 396 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.86 
 
 		 341 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  30.62 
 
 		 597 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 745 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  23.02 
 
 		 728 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.24 
 
 		 624 aa  117  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.96 
 
 		 2816 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.07 
 
 		 817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  30.72 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.29 
 
 		 787 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.32 
 
 		 638 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  31.36 
 
 		 450 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.12 
 
 		 618 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.17 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.31 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.38 
 
 		 544 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  29.97 
 
 		 328 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.5 
 
 		 390 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  29.48 
 
 		 575 aa  101  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  30.5 
 
 		 298 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  32.31 
 
 		 371 aa  98.2  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  30.68 
 
 		 602 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.14 
 
 		 941 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  31.63 
 
 		 295 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.14 
 
 		 643 aa  94.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  31.38 
 
 		 295 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  28.81 
 
 		 643 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  28.32 
 
 		 399 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  22.92 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  31.03 
 
 		 260 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.08 
 
 		 332 aa  87.4  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.64 
 
 		 1147 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  24.65 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  28.62 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  28.64 
 
 		 1408 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>