153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4652 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
555 aa  1055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  63.64 
 
 
558 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  68.12 
 
 
546 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  64.77 
 
 
556 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.59 
 
 
570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  65.3 
 
 
555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  66.61 
 
 
554 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  60.53 
 
 
569 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  58.38 
 
 
558 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  58.21 
 
 
553 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  57.6 
 
 
551 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  59.47 
 
 
566 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  63.44 
 
 
554 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  55.77 
 
 
567 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  61.09 
 
 
560 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  59.23 
 
 
579 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  58.86 
 
 
563 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  56.78 
 
 
561 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  53.73 
 
 
577 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  65.17 
 
 
477 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  56.52 
 
 
792 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  54.84 
 
 
784 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  54.57 
 
 
776 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  47.33 
 
 
778 aa  299  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.24 
 
 
837 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.8 
 
 
1848 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  49.03 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.23 
 
 
417 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  41.57 
 
 
593 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  38.59 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  33.01 
 
 
461 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  40.52 
 
 
1129 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.28 
 
 
821 aa  187  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.07 
 
 
209 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  44.67 
 
 
376 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.31 
 
 
911 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.97 
 
 
1919 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.89 
 
 
2082 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  40.85 
 
 
835 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  37.3 
 
 
743 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  40.74 
 
 
681 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.84 
 
 
737 aa  180  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.37 
 
 
818 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  35.83 
 
 
717 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  39.23 
 
 
443 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  33.65 
 
 
714 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  31.73 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
1679 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  39.83 
 
 
389 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.23 
 
 
706 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  34.09 
 
 
449 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
469 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.61 
 
 
726 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.5 
 
 
341 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  34.65 
 
 
363 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  34.65 
 
 
363 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  35.01 
 
 
624 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.28 
 
 
941 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  35 
 
 
1207 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  30.67 
 
 
807 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  32.87 
 
 
1187 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.08 
 
 
787 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.58 
 
 
547 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  35.76 
 
 
638 aa  136  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.26 
 
 
817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.83 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
745 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  32.25 
 
 
533 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  61.54 
 
 
209 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  33.84 
 
 
1222 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  29.51 
 
 
375 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.18 
 
 
692 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  28.61 
 
 
728 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  33.59 
 
 
544 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.11 
 
 
1147 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  31.12 
 
 
602 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.89 
 
 
900 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.97 
 
 
390 aa  114  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  31.67 
 
 
447 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  32.82 
 
 
450 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  34.92 
 
 
332 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.06 
 
 
454 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.7 
 
 
810 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  30.84 
 
 
418 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  29.54 
 
 
454 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.44 
 
 
547 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.15 
 
 
618 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.97 
 
 
921 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  31.44 
 
 
328 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.4 
 
 
1126 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  30.65 
 
 
558 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.78 
 
 
597 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  31.35 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.8 
 
 
727 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  27.8 
 
 
1312 aa  97.1  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  32.18 
 
 
643 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  34.68 
 
 
307 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  34.29 
 
 
2816 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  31.05 
 
 
575 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.36 
 
 
643 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>