154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0264 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  79.14 
 
 
784 aa  1075    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  78.16 
 
 
778 aa  1069    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  79.77 
 
 
776 aa  1085    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  64.68 
 
 
837 aa  793    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
792 aa  1507    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.27 
 
 
821 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  39.65 
 
 
1187 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  38.2 
 
 
743 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.46 
 
 
818 aa  392  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  39.48 
 
 
1207 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.27 
 
 
717 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  66.18 
 
 
553 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  57.82 
 
 
389 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  40.06 
 
 
714 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.77 
 
 
2082 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  59.89 
 
 
554 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.46 
 
 
911 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  54.47 
 
 
477 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.38 
 
 
561 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  57.49 
 
 
546 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  57.18 
 
 
569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.74 
 
 
563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  56.25 
 
 
560 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  56.52 
 
 
555 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.26 
 
 
556 aa  300  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  53.11 
 
 
579 aa  297  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  55.49 
 
 
553 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  51.35 
 
 
551 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.85 
 
 
567 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.88 
 
 
555 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  52.57 
 
 
558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.98 
 
 
570 aa  276  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  49.47 
 
 
554 aa  270  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  52.61 
 
 
376 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  43.64 
 
 
835 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  49.05 
 
 
577 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  43.95 
 
 
593 aa  248  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.85 
 
 
417 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  53.64 
 
 
566 aa  235  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.11 
 
 
1848 aa  234  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  45.24 
 
 
558 aa  230  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  36.12 
 
 
1222 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.39 
 
 
787 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  43.47 
 
 
941 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.44 
 
 
1129 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  39.85 
 
 
817 aa  225  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.25 
 
 
1126 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.89 
 
 
1919 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  37.54 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  45.88 
 
 
681 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  37.82 
 
 
461 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  43.58 
 
 
544 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.06 
 
 
810 aa  211  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  42.55 
 
 
638 aa  208  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  40.9 
 
 
443 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  41.26 
 
 
403 aa  205  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.81 
 
 
807 aa  204  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.09 
 
 
469 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.68 
 
 
1679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
745 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  39.23 
 
 
449 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  38.66 
 
 
618 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  36.51 
 
 
447 aa  197  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.57 
 
 
706 aa  195  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.42 
 
 
1147 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  36.06 
 
 
454 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.94 
 
 
363 aa  190  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.94 
 
 
363 aa  190  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.38 
 
 
535 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  33.56 
 
 
575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  40.75 
 
 
602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  33.79 
 
 
726 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.3 
 
 
728 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  39.64 
 
 
737 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  33.23 
 
 
341 aa  148  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  36.61 
 
 
900 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  33.42 
 
 
547 aa  144  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  30.53 
 
 
375 aa  140  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  34.46 
 
 
396 aa  138  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.18 
 
 
454 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  34.2 
 
 
450 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.57 
 
 
921 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.26 
 
 
326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.99 
 
 
692 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.88 
 
 
418 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  33.23 
 
 
328 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  31.5 
 
 
597 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.62 
 
 
209 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  28.64 
 
 
558 aa  111  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.52 
 
 
14609 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.47 
 
 
624 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  31.16 
 
 
390 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  32.23 
 
 
547 aa  104  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  28.41 
 
 
499 aa  101  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.34 
 
 
643 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.46 
 
 
727 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  34.48 
 
 
375 aa  97.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  29.65 
 
 
533 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  32.15 
 
 
643 aa  95.5  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  26.86 
 
 
1312 aa  95.1  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>