146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1585 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
570 aa  1074    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  64.49 
 
 
569 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  61.79 
 
 
558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  65.19 
 
 
555 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.97 
 
 
567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  61.77 
 
 
551 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  61.52 
 
 
553 aa  569  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  63 
 
 
555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  65.6 
 
 
554 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  60.92 
 
 
566 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  66.42 
 
 
560 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  57.14 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  61.66 
 
 
579 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  61.38 
 
 
556 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  64.6 
 
 
546 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  58.74 
 
 
577 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  60.11 
 
 
554 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.72 
 
 
561 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.01 
 
 
563 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  62.68 
 
 
477 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  54.83 
 
 
792 aa  320  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  53.89 
 
 
778 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  55.34 
 
 
784 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  48.97 
 
 
776 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.67 
 
 
1848 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.74 
 
 
837 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.55 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  42.41 
 
 
593 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.84 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  43.66 
 
 
403 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  34.78 
 
 
911 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.4 
 
 
1919 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  44.27 
 
 
681 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  33.95 
 
 
743 aa  190  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40.48 
 
 
2082 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  38.6 
 
 
443 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  62.29 
 
 
209 aa  180  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  43.79 
 
 
376 aa  177  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  41.16 
 
 
737 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  40.92 
 
 
717 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  41.09 
 
 
389 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  34.87 
 
 
714 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32.86 
 
 
461 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.53 
 
 
1679 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.11 
 
 
461 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.86 
 
 
818 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.26 
 
 
1129 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.28 
 
 
821 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  38.21 
 
 
835 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.53 
 
 
726 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.08 
 
 
706 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.76 
 
 
787 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.82 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  34.22 
 
 
363 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  34.22 
 
 
363 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  34.19 
 
 
1187 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.13 
 
 
817 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  30.26 
 
 
807 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  34.67 
 
 
449 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.01 
 
 
941 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  34.44 
 
 
1207 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
745 aa  136  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.77 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  35.09 
 
 
638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.33 
 
 
535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  37.59 
 
 
618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  35.88 
 
 
900 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.95 
 
 
1222 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  33.67 
 
 
418 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.37 
 
 
692 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 
624 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  59.8 
 
 
209 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.83 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.71 
 
 
1147 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  33.33 
 
 
643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  33.22 
 
 
533 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.3 
 
 
2816 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.01 
 
 
390 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.93 
 
 
810 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  35.05 
 
 
602 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  35.97 
 
 
332 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  30.92 
 
 
454 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  37.67 
 
 
375 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.23 
 
 
728 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  32.86 
 
 
447 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
450 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 
547 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  31.06 
 
 
328 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  30.34 
 
 
1312 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  31.03 
 
 
575 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.05 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.79 
 
 
1126 aa  97.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.34 
 
 
921 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.25 
 
 
547 aa  96.7  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  28.61 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  29.06 
 
 
643 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  28.35 
 
 
727 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  32.21 
 
 
396 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  28.74 
 
 
783 aa  90.9  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>