159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2304 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  100 
 
 
461 aa  926    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  40.65 
 
 
461 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.4 
 
 
1679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.69 
 
 
821 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  43.24 
 
 
911 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  39.63 
 
 
807 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.57 
 
 
1919 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.42 
 
 
818 aa  279  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.04 
 
 
2082 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  36.99 
 
 
547 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  41.81 
 
 
717 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  42.31 
 
 
714 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  37.22 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.2 
 
 
778 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  37.82 
 
 
792 aa  216  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.21 
 
 
554 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  35.98 
 
 
784 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.54 
 
 
1129 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  35.54 
 
 
776 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.94 
 
 
837 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.43 
 
 
743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  50.51 
 
 
692 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.9 
 
 
477 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.26 
 
 
563 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  33.85 
 
 
553 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.71 
 
 
593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.07 
 
 
561 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  36.63 
 
 
569 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.31 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  31.85 
 
 
560 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.64 
 
 
555 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.36 
 
 
417 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.02 
 
 
556 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.45 
 
 
546 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.12 
 
 
1848 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  33.05 
 
 
363 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.1 
 
 
579 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  33.05 
 
 
363 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
835 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.37 
 
 
567 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.58 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.92 
 
 
570 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.82 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  33.95 
 
 
726 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  34.44 
 
 
577 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.84 
 
 
553 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.82 
 
 
551 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.98 
 
 
1126 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  37.23 
 
 
376 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.94 
 
 
555 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.92 
 
 
681 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.94 
 
 
706 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.99 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  52.7 
 
 
1222 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.69 
 
 
737 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  34.58 
 
 
566 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  29.14 
 
 
575 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.35 
 
 
810 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  29.23 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  31.23 
 
 
389 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
745 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.89 
 
 
443 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.6 
 
 
817 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.39 
 
 
900 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.12 
 
 
787 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  30.54 
 
 
638 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.13 
 
 
597 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  26.15 
 
 
396 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  26.01 
 
 
418 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  27.6 
 
 
1207 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  28.17 
 
 
1187 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.03 
 
 
341 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  31.58 
 
 
618 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  30.22 
 
 
558 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.02 
 
 
728 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.63 
 
 
921 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  28.77 
 
 
602 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  31.11 
 
 
624 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
544 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  33.52 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.71 
 
 
643 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.52 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  26.03 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.25 
 
 
941 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  24.22 
 
 
727 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.95 
 
 
1147 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  27.78 
 
 
1312 aa  83.2  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.75 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.94 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.24 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25.93 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  32.04 
 
 
450 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  24.73 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  27.8 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  22.97 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  30.69 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.64 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  25.96 
 
 
2816 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  22.16 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>