30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42978 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  100 
 
 
632 aa  1317    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  24.95 
 
 
639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  31.56 
 
 
506 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  28.05 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32786  predicted protein  29.3 
 
 
660 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_4529  predicted protein  29.7 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  32.47 
 
 
713 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2897  predicted protein  27.7 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000438685  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
1556 aa  67.8  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40282  predicted protein  27.07 
 
 
344 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  22.11 
 
 
970 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  30.09 
 
 
577 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31664  predicted protein  26.12 
 
 
878 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0284916 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  28.93 
 
 
1474 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24976  predicted protein  26.36 
 
 
936 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  26.09 
 
 
312 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 
406 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  32.39 
 
 
923 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 
508 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  29.46 
 
 
347 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  22.07 
 
 
1448 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  24.03 
 
 
321 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02090  Kelch repeats protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04970)  26.83 
 
 
677 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.33 
 
 
993 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27814  predicted protein  28.29 
 
 
1546 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.208046  normal  0.12178 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  22.88 
 
 
710 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
461 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.05 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  24.55 
 
 
368 aa  44.3  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23.83 
 
 
1656 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>