57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0386 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
406 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.86 
 
 
639 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  27.68 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  28.97 
 
 
710 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  28.41 
 
 
924 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  27.27 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  25.44 
 
 
536 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  25.44 
 
 
536 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 
1556 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37571  predicted protein  33.67 
 
 
174 aa  63.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02090  Kelch repeats protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04970)  29.24 
 
 
677 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_93530  predicted protein  22.68 
 
 
842 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.71 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  21.43 
 
 
970 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  26.34 
 
 
347 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.48 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  26.2 
 
 
508 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  20.07 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.62 
 
 
1762 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08430  Kelch repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12780)  24.81 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  25.65 
 
 
1474 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94478  predicted protein  29.11 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  26.79 
 
 
632 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.86 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.1 
 
 
471 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  24.53 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24976  predicted protein  28.18 
 
 
936 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  23.83 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  23.83 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  23.83 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39095  predicted protein  24.31 
 
 
338 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.83 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.83 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93077  predicted protein  33.76 
 
 
177 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.874652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  25.97 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  23.33 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.91 
 
 
334 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.83 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.71 
 
 
1557 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  30.28 
 
 
990 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  30.81 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 
2942 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  28.47 
 
 
358 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2897  predicted protein  27.65 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  32.37 
 
 
923 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.77 
 
 
1407 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25 
 
 
497 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  30.04 
 
 
693 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.23 
 
 
465 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03470  expressed protein  26.45 
 
 
1146 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.33 
 
 
698 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>