43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4835 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  99.18 
 
 		 368 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  99.18 
 
 		 368 aa  741    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  98.1 
 
 		 368 aa  737    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  100 
 
 		 368 aa  748    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  98.37 
 
 		 368 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  98.64 
 
 		 368 aa  737    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  99.18 
 
 		 368 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.91 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.64 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.91 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.91 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.88 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.88 
 
 		 392 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.6 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  35.18 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.72 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  29.63 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3891  hypothetical protein  93.83 
 
 		 92 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  28.81 
 
 		 418 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  25.62 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  26.17 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 		 883 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  26.18 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1514 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  26.07 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1557 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  33.68 
 
 		 990 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  36.56 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  22.81 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.63 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  23.83 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 693 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 850 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  39.73 
 
 		 1474 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  37.33 
 
 		 1762 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  23.48 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.49 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 		 812 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>