More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0474 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  100 
 
 		 471 aa  947    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 508 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.24 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1557 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1762 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.98 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  32.83 
 
 		 339 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.32 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 776 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.87 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.23 
 
 		 312 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  31.68 
 
 		 321 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.5 
 
 		 2942 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  29.35 
 
 		 318 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  31 
 
 		 317 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.34 
 
 		 812 aa  86.7  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  35.23 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  30.69 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1009 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.53 
 
 		 1009 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.53 
 
 		 1017 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.82 
 
 		 990 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  28.52 
 
 		 717 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  30.6 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 250 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  26.78 
 
 		 795 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 1556 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.46 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  57.58 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  58.46 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 228 aa  76.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  56.25 
 
 		 213 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 212 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  31.28 
 
 		 993 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50.82 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 		 693 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  57.63 
 
 		 119 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.44 
 
 		 1656 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.46 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  28.49 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 894 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  55.74 
 
 		 207 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1514 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  48.57 
 
 		 921 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  47.69 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  47.69 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 970 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  50.77 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  55 
 
 		 901 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  54.55 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 967 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  47.83 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1407 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  51.72 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>