More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3710 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 426 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0091  regulatory protein LuxR  39.71 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  38.3 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  56.25 
 
 		 913 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 914 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  55 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  54.39 
 
 		 896 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  47.13 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 209 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 911 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  51.47 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  48.48 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  53.73 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  49.12 
 
 		 901 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  56.14 
 
 		 913 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  54.55 
 
 		 933 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  38.6 
 
 		 894 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  51.67 
 
 		 779 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  55.36 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.79 
 
 		 889 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.36 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  54.24 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 238 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  32.31 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  32.31 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  55.17 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 993 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0966  transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 970 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.3 
 
 		 896 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  49.12 
 
 		 907 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.67 
 
 		 930 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  49.12 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  49.12 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  39.02 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>