74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2899 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 321 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  54.14 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  49.66 
 
 		 1656 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  33 
 
 		 1461 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  32.99 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.01 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  32.3 
 
 		 445 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.47 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.69 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1762 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.25 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.35 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.35 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  25.99 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.05 
 
 		 990 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1557 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  28.4 
 
 		 776 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.17 
 
 		 812 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.57 
 
 		 795 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  25.25 
 
 		 993 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 2942 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  25.33 
 
 		 1017 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  25.67 
 
 		 1009 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 		 1009 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.88 
 
 		 693 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  25.83 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  24.87 
 
 		 717 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25.29 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  25.96 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  23.29 
 
 		 698 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  23.88 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  27.62 
 
 		 595 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  25.31 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  27.18 
 
 		 588 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.98 
 
 		 450 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.4 
 
 		 725 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  27.21 
 
 		 577 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545063 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  24.81 
 
 		 1474 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  23.91 
 
 		 586 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  25.09 
 
 		 483 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 1556 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  21.55 
 
 		 639 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.34 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1407 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 557 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  27.75 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  24.03 
 
 		 632 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  25 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 		 1451 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.18 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  24.76 
 
 		 642 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  23.94 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.55 
 
 		 1453 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  27.84 
 
 		 536 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  27.84 
 
 		 536 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  24.37 
 
 		 605 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.04 
 
 		 646 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  25.75 
 
 		 506 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  24.49 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  23.26 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  26.29 
 
 		 484 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  23.5 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  21.76 
 
 		 460 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1514 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  24.81 
 
 		 710 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 1215 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  26 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>