49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3103 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1200    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  94.55 
 
 
595 aa  1100    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.54 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  25.23 
 
 
312 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.83 
 
 
344 aa  61.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3021  hypothetical protein  30.88 
 
 
244 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  23.94 
 
 
341 aa  57.4  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.18 
 
 
321 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  38.75 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  23.4 
 
 
334 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.94 
 
 
1762 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.07 
 
 
795 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.63 
 
 
1035 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.7 
 
 
1557 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
776 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  36.36 
 
 
1079 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.62 
 
 
326 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.27 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.89 
 
 
693 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.33 
 
 
695 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  26.97 
 
 
336 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  31.3 
 
 
607 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
726 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  28.21 
 
 
1031 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.62 
 
 
669 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  25.64 
 
 
243 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  30.68 
 
 
416 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
471 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.55 
 
 
1679 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  26.74 
 
 
406 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 
2942 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.34 
 
 
2690 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.29 
 
 
2239 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0654  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  39.34 
 
 
1437 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  29.79 
 
 
887 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0295  hypothetical protein  31.08 
 
 
621 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  28.57 
 
 
843 aa  44.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.73 
 
 
2002 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1169  hypothetical protein  37.25 
 
 
64 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00514608  decreased coverage  0.00854955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  33.61 
 
 
1303 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1798  immunoreactive 46 kDa antigen PG99  31.58 
 
 
405 aa  43.9  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  32.47 
 
 
1163 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  21.96 
 
 
508 aa  43.9  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  28.41 
 
 
2443 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  29.7 
 
 
180 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  37.14 
 
 
558 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>