74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01750 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1372    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  46.08 
 
 		 788 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  35.23 
 
 		 623 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  31.26 
 
 		 712 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  36.51 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  27.84 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  37.46 
 
 		 679 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  37.59 
 
 		 311 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  35.33 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  37.92 
 
 		 361 aa  151  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  33.65 
 
 		 303 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  35.18 
 
 		 318 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  24.27 
 
 		 601 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  30.3 
 
 		 334 aa  91.3  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  47.87 
 
 		 791 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  39.52 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  44 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  36.73 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  25.45 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  42.55 
 
 		 539 aa  77  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  38.69 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  35.29 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  41.9 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  26.46 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  27.49 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  32.1 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  26.72 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  34.59 
 
 		 311 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  43.68 
 
 		 311 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  32.38 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  24.81 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  39.19 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  36 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 		 333 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  41.33 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  33.09 
 
 		 1028 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  31.4 
 
 		 243 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  27.04 
 
 		 355 aa  54.3  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.71 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1389 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1031 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  30.91 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  34.67 
 
 		 654 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.33 
 
 		 1441 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  29.63 
 
 		 827 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  34.83 
 
 		 500 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  33.33 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.09 
 
 		 1679 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  32.98 
 
 		 356 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  28.74 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1070 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  30.86 
 
 		 662 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  28.16 
 
 		 1250 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  33.77 
 
 		 924 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398397  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  33.33 
 
 		 984 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  37.31 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  25.44 
 
 		 1251 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  34.62 
 
 		 595 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  36.84 
 
 		 469 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  35.63 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  34.52 
 
 		 1096 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  34.62 
 
 		 588 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  30.39 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  29.36 
 
 		 750 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  30 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1093 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  34.21 
 
 		 1116 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  35.21 
 
 		 733 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.03 
 
 		 2239 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30 
 
 		 801 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.44 
 
 		 752 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 615 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>