33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04980 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  749    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  46.69 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  42.21 
 
 
303 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  47.41 
 
 
311 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  45.56 
 
 
679 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  32.7 
 
 
712 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  33.02 
 
 
713 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  32.08 
 
 
623 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  35.79 
 
 
788 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  37.92 
 
 
669 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  38.4 
 
 
425 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  35.22 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  38.21 
 
 
306 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  37.64 
 
 
455 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  36.8 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  36.56 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  34.4 
 
 
338 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  34.33 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  34.48 
 
 
351 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
333 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  28.24 
 
 
322 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  32.48 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  35.16 
 
 
327 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  30.8 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  29.79 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  35.87 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  29.05 
 
 
693 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  30.8 
 
 
588 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  31.3 
 
 
500 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  28.95 
 
 
601 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  34.01 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  23.9 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  23.44 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>