36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3096 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  100 
 
 		 327 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  52.78 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  52.71 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  59.39 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  60.99 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  54.02 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  48.71 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  45.95 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  38.46 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  39.02 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  46.95 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  43.53 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  34.66 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  35.25 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  36.92 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  35 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  30.68 
 
 		 713 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  33.62 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  33.6 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  43.45 
 
 		 712 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  28.1 
 
 		 588 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  35.68 
 
 		 679 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  33.06 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  26.42 
 
 		 559 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  29.17 
 
 		 693 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  29.41 
 
 		 425 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  29.62 
 
 		 788 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  31 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  28.68 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.36 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  27.56 
 
 		 601 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4265  hypothetical protein  47.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.520051  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1062 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4242  hypothetical protein  45.28 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4113  hypothetical protein  45.28 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.638462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  34.31 
 
 		 859 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>