29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45412 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  100 
 
 
500 aa  1023    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  33.94 
 
 
334 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  33.6 
 
 
312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  37.14 
 
 
322 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  34.3 
 
 
327 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  32.03 
 
 
294 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  36.65 
 
 
311 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  34 
 
 
306 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  37.64 
 
 
288 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  40 
 
 
327 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  33.76 
 
 
338 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  29.08 
 
 
351 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 
333 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  32.54 
 
 
279 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  27.44 
 
 
559 aa  70.1  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  27.73 
 
 
588 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  30.65 
 
 
693 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  38.54 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  31.3 
 
 
361 aa  60.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  31.9 
 
 
712 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  37.78 
 
 
455 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.83 
 
 
669 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  28.83 
 
 
713 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  32.81 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  33 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  32.08 
 
 
623 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  32 
 
 
354 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.94 
 
 
2751 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  26.06 
 
 
859 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>