40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01825 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  100 
 
 
654 aa  1289    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  43.6 
 
 
216 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  42.25 
 
 
112 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2429  hypothetical protein  29.94 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  36.67 
 
 
827 aa  68.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  41.67 
 
 
617 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  41.56 
 
 
365 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  38.64 
 
 
927 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  37.08 
 
 
935 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  32.23 
 
 
884 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  38.16 
 
 
1093 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  25.58 
 
 
1031 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  38.89 
 
 
1154 aa  54.3  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  35.2 
 
 
772 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.67 
 
 
669 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.91 
 
 
2160 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  32.94 
 
 
1070 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  34.83 
 
 
1441 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  36.36 
 
 
1024 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  47.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0192  hypothetical protein  30.34 
 
 
680 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160216  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  31.25 
 
 
798 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.88 
 
 
1003 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  34.78 
 
 
613 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  39.19 
 
 
739 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  31.46 
 
 
657 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  30.85 
 
 
742 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  33.33 
 
 
827 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32 
 
 
727 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
848 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  28.22 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  37.84 
 
 
1250 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  27.48 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.97 
 
 
1679 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  33.85 
 
 
469 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  36.14 
 
 
528 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0352  hypothetical protein  36.25 
 
 
109 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.371512  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
541 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  25.77 
 
 
567 aa  43.9  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  34.72 
 
 
545 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>