34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2505 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  43.54 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  41.67 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  47.12 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  46.93 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  41.96 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  37.76 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  45.58 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  38.6 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  38.66 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  36.1 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  35.47 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  32.59 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  35.8 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  34.33 
 
 		 361 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  32.03 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  32.23 
 
 		 559 aa  99.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  31.43 
 
 		 693 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  39.61 
 
 		 679 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  28.75 
 
 		 713 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  40 
 
 		 588 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  30.59 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  28.38 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.01 
 
 		 455 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  28.79 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  29.11 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  27.49 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  26.12 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1062 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  32.65 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  23.21 
 
 		 601 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>