27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45988 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  100 
 
 
693 aa  1419    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  75.36 
 
 
559 aa  773    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  62 
 
 
588 aa  604  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  36.13 
 
 
327 aa  100  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  33.33 
 
 
351 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  31.43 
 
 
294 aa  97.8  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  94.4  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  31.33 
 
 
312 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  31.66 
 
 
322 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  34.26 
 
 
334 aa  91.3  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  31.18 
 
 
288 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  35.14 
 
 
327 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  30.33 
 
 
279 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  30.62 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  31.07 
 
 
311 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  30.61 
 
 
500 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  29.05 
 
 
361 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  35.57 
 
 
311 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  27.42 
 
 
318 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  27.53 
 
 
788 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  31.82 
 
 
679 aa  53.9  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  35.45 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  29.94 
 
 
713 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  34.09 
 
 
623 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>