34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2972 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  100 
 
 		 623 aa  1298    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  37.76 
 
 		 788 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  42.81 
 
 		 679 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.42 
 
 		 669 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  38.74 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  39.81 
 
 		 303 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  28.69 
 
 		 712 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  40.36 
 
 		 311 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  36.43 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  32.84 
 
 		 361 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  29.75 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  32.68 
 
 		 318 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  29.17 
 
 		 322 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.93 
 
 		 601 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  30.65 
 
 		 351 aa  88.2  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  31.05 
 
 		 306 aa  87.4  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  30.42 
 
 		 334 aa  87.8  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  29.81 
 
 		 288 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  34.02 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  31.7 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  32.95 
 
 		 327 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  28.57 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  28.77 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  28.57 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  27.7 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  26.45 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  28.77 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  36.57 
 
 		 588 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  36.73 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  32.72 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  34.81 
 
 		 693 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  34.67 
 
 		 1187 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>