21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2701 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  745    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  76.26 
 
 		 354 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  30.27 
 
 		 713 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  27.76 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  31.65 
 
 		 679 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  28.91 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  28.18 
 
 		 601 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  28.08 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  24.9 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  27.8 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  28.17 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  27.04 
 
 		 669 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  27.34 
 
 		 455 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  29.88 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1062 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  25.75 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  33 
 
 		 500 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  32.65 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  24.8 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  36.84 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  33.81 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>