35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4739 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  52.71 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  59.39 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  59.56 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  57.14 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  58.41 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  47.94 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  45.98 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  42.21 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  42.23 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  45.58 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  36.79 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  40.19 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  34.31 
 
 		 713 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  33.6 
 
 		 500 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  33.45 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  30.96 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  34.76 
 
 		 679 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  27.82 
 
 		 712 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  31.85 
 
 		 588 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  31.33 
 
 		 693 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 788 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  31.92 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  31.73 
 
 		 559 aa  89  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  30.13 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  25.45 
 
 		 669 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  25.91 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.54 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  24.34 
 
 		 601 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  29.72 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  28.17 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1062 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  29.6 
 
 		 859 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>