101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1580 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1252    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  28.85 
 
 		 712 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  27.71 
 
 		 311 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  34.35 
 
 		 501 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  29.63 
 
 		 679 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  24.27 
 
 		 669 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  27.76 
 
 		 623 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.08 
 
 		 1575 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  36.67 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  29.96 
 
 		 755 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  34.54 
 
 		 996 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1263 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  36.07 
 
 		 543 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  33.51 
 
 		 1174 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  27.32 
 
 		 788 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.53 
 
 		 1437 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.94 
 
 		 1433 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  29.23 
 
 		 303 aa  87  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  37.04 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30.81 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.29 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  28.03 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1003 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  33.15 
 
 		 324 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.28 
 
 		 1668 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  32.79 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  32.34 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.7 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  30 
 
 		 571 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1294 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.24 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1029 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  34.81 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  28.89 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.85 
 
 		 1783 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1318 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  33.87 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.96 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  27.17 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  32.28 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1147 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  30.13 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.26 
 
 		 803 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  27.68 
 
 		 477 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  25.66 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  31.35 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  32.95 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  34.27 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.09 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  31.84 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  29.95 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  30.27 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 		 1773 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1215 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  27.17 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  34.43 
 
 		 367 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  24.22 
 
 		 425 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  27.43 
 
 		 336 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.69 
 
 		 1015 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28.49 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  27.41 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  32.02 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  35.2 
 
 		 1296 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  25.24 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  30.96 
 
 		 701 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  30.14 
 
 		 933 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.63 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.89 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.48 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  31.25 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  31.03 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  31.88 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  31.79 
 
 		 230 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.38 
 
 		 570 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  32.89 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  25.62 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 853 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  30.91 
 
 		 725 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 		 728 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  26.01 
 
 		 693 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.67 
 
 		 688 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  30.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  24.55 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 		 1797 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  24.39 
 
 		 294 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.41 
 
 		 3737 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  27.56 
 
 		 327 aa  50.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  38.95 
 
 		 308 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  44.12 
 
 		 4429 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  23.99 
 
 		 322 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  29.05 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1024 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.03 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  24.04 
 
 		 859 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  28.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>