34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0928 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  656    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  63.8 
 
 
311 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  58.22 
 
 
288 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  45.78 
 
 
334 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  46.05 
 
 
327 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  44.44 
 
 
312 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  43.16 
 
 
306 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  43.48 
 
 
338 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  45.5 
 
 
327 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  42.67 
 
 
351 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  37.41 
 
 
311 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
333 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  38.66 
 
 
294 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  33.77 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  38.27 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  27.89 
 
 
713 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  33.46 
 
 
311 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  28.99 
 
 
361 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  30.37 
 
 
588 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  28.3 
 
 
623 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  31.66 
 
 
693 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  31.96 
 
 
559 aa  89.7  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  30.95 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  29.64 
 
 
679 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  27.45 
 
 
712 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  28.96 
 
 
788 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  28.33 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  27.66 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  26.72 
 
 
669 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  25.97 
 
 
859 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  21.43 
 
 
1062 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  31.53 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  35.35 
 
 
355 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>