38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0319 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1483    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  42.24 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  41.08 
 
 		 679 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  42.52 
 
 		 303 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  35.69 
 
 		 311 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  27.84 
 
 		 669 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  32.08 
 
 		 361 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  35.15 
 
 		 318 aa  154  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  34.7 
 
 		 788 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  29.75 
 
 		 623 aa  150  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  34.31 
 
 		 312 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  31.67 
 
 		 334 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  32.53 
 
 		 351 aa  125  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  31.72 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.94 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  31.14 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  34.11 
 
 		 306 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  33.45 
 
 		 338 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  30.27 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  27.89 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  37.5 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  31.84 
 
 		 288 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 333 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  30.29 
 
 		 327 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  28.39 
 
 		 354 aa  94  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  29.29 
 
 		 294 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  27.5 
 
 		 311 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  24.56 
 
 		 279 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.88 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  28.57 
 
 		 707 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  32.9 
 
 		 588 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  32.47 
 
 		 559 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1031 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  28.83 
 
 		 500 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  29.94 
 
 		 693 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  37.31 
 
 		 859 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1449 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  27.17 
 
 		 725 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>