44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0049 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 1449 aa  2967    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  37.32 
 
 		 1147 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0182  hypothetical protein  39.2 
 
 		 647 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 958 aa  100  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5191  hypothetical protein  23.75 
 
 		 278 aa  72  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.58 
 
 		 809 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 808 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 796 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  36.78 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1215 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  31.4 
 
 		 617 aa  55.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  24.73 
 
 		 1295 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  23.91 
 
 		 1275 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.11 
 
 		 537 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  36.47 
 
 		 452 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3322  hypothetical protein  27.78 
 
 		 506 aa  51.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.213782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1683  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  51.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  30.51 
 
 		 827 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  31.17 
 
 		 549 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  36.47 
 
 		 418 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3989  hypothetical protein  26.81 
 
 		 490 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.572227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2784  hypothetical protein  36.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.188398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  23.81 
 
 		 788 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 1737 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1122  hypothetical protein  36.78 
 
 		 195 aa  50.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  24.59 
 
 		 887 aa  49.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  49.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  29.07 
 
 		 713 aa  48.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  21.69 
 
 		 461 aa  48.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  27.84 
 
 		 908 aa  48.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  30.26 
 
 		 356 aa  48.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  26.67 
 
 		 713 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  29.29 
 
 		 997 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  30.19 
 
 		 884 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 1343 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.29 
 
 		 363 aa  47.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  32.84 
 
 		 235 aa  47  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.18 
 
 		 1206 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  29.49 
 
 		 1154 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  35 
 
 		 256 aa  46.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.21 
 
 		 1362 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.17 
 
 		 874 aa  45.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  19.47 
 
 		 810 aa  45.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  23.75 
 
 		 373 aa  45.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>