32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3880 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  56.71 
 
 
322 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  51.64 
 
 
311 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  48.44 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  46.84 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  44.2 
 
 
334 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  42.28 
 
 
351 aa  205  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  47.96 
 
 
306 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  48.23 
 
 
338 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  40 
 
 
294 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  44.59 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 
333 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  36.98 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  38.33 
 
 
279 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  37.63 
 
 
500 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  30.34 
 
 
713 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  32.22 
 
 
361 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  31.66 
 
 
588 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  30.93 
 
 
693 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  30.88 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  31.44 
 
 
559 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  39.04 
 
 
712 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  30.22 
 
 
623 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  30.03 
 
 
788 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  30.19 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  32.24 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  35.76 
 
 
455 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  29.03 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  30.22 
 
 
679 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  26.46 
 
 
669 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  23.33 
 
 
859 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  29.06 
 
 
1062 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>