25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09243 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  100 
 
 
1031 aa  2052    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  48.48 
 
 
1441 aa  264  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  35.71 
 
 
874 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05425  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  63.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  35.16 
 
 
617 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  36.23 
 
 
469 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  22.4 
 
 
1070 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.5 
 
 
2364 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  25.58 
 
 
654 aa  54.7  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  27.59 
 
 
713 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.63 
 
 
669 aa  52.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  29.89 
 
 
2239 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04105  hypothetical protein  23.08 
 
 
349 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  32.97 
 
 
827 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  28.72 
 
 
595 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  31.11 
 
 
887 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  33.8 
 
 
550 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  27.5 
 
 
356 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  27.78 
 
 
757 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.36 
 
 
1154 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  28.21 
 
 
588 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  33.71 
 
 
1118 aa  45.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  32.39 
 
 
324 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  34.88 
 
 
1389 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  33.33 
 
 
416 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>