35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0488 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  634    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  51.83 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  54.44 
 
 		 338 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  51.5 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  54.72 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  50.75 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  43.59 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  44.7 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  45.57 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  43.16 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  47.95 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  42.22 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  36.94 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  36.44 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  38.21 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  36.93 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  34.11 
 
 		 713 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  33.33 
 
 		 500 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  33.6 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  29.8 
 
 		 559 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  32.92 
 
 		 693 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  32.81 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  27.54 
 
 		 588 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  39.71 
 
 		 712 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  33.99 
 
 		 679 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  29.79 
 
 		 425 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  30.26 
 
 		 623 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  38.97 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  30.25 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  27.55 
 
 		 669 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  25.41 
 
 		 859 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1062 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  33.81 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  33.81 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  24.3 
 
 		 853 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>