33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1716 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  63.8 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  51.13 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  38.92 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  41.1 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  42.23 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  46.67 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  42.22 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  45.05 
 
 		 351 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  43.1 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  38.4 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  37.22 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  35.59 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  31.14 
 
 		 713 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  36.41 
 
 		 500 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  30.65 
 
 		 712 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  34.65 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  31.51 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  31.8 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  31.88 
 
 		 425 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  31.22 
 
 		 588 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  30.62 
 
 		 693 aa  85.9  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  32.02 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  33.13 
 
 		 559 aa  82.4  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  26.92 
 
 		 788 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  35.33 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  30.94 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  28.14 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.59 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.45 
 
 		 601 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  36.84 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  35.79 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>