31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0377 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  100 
 
 
327 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  43.14 
 
 
351 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  49.13 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  45.9 
 
 
306 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  46.64 
 
 
322 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  42.76 
 
 
312 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  46.89 
 
 
327 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  44.01 
 
 
311 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  46.28 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  38.92 
 
 
334 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  38.17 
 
 
333 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  35.82 
 
 
294 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  35.77 
 
 
279 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  31 
 
 
311 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  30.77 
 
 
713 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  33.06 
 
 
361 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  40 
 
 
500 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  33.99 
 
 
318 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  36.13 
 
 
693 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  32.62 
 
 
588 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  32.86 
 
 
712 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  32.17 
 
 
559 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  32.39 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  31.82 
 
 
425 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  30.9 
 
 
669 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  32.4 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  32.65 
 
 
623 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  29 
 
 
788 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  31.17 
 
 
679 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  28.16 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  23.19 
 
 
601 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>