36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0456 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  100 
 
 		 1062 aa  2186    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  26.3 
 
 		 853 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  34.44 
 
 		 859 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  45.05 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.39 
 
 		 2068 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  30.34 
 
 		 480 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.92 
 
 		 1042 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.55 
 
 		 527 aa  57.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.32 
 
 		 1380 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  26.95 
 
 		 279 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.34 
 
 		 779 aa  55.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.01 
 
 		 4433 aa  55.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.69 
 
 		 1363 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  22.41 
 
 		 334 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1294 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  22.05 
 
 		 3333 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  28.34 
 
 		 1363 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  21.43 
 
 		 322 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  24.59 
 
 		 1973 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  31.9 
 
 		 355 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  30.6 
 
 		 3507 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  41.54 
 
 		 861 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  26.58 
 
 		 354 aa  48.5  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 333 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  23.43 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  21.74 
 
 		 601 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  32.38 
 
 		 351 aa  47  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.18 
 
 		 999 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  24.49 
 
 		 1248 aa  46.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  29.81 
 
 		 306 aa  46.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  30.09 
 
 		 294 aa  45.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  32.69 
 
 		 327 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29.73 
 
 		 9585 aa  45.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  26.39 
 
 		 701 aa  44.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  30.19 
 
 		 455 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  28.12 
 
 		 1154 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>