146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0574 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  42.99 
 
 		 3507 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 4433 aa  8985    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  42.69 
 
 		 2068 aa  804    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  36.1 
 
 		 2286 aa  625  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  33.09 
 
 		 485 aa  142  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  32.94 
 
 		 471 aa  136  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  35.01 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  34.1 
 
 		 436 aa  128  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.9 
 
 		 779 aa  122  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.99 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  32.31 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  31.49 
 
 		 439 aa  109  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  108  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  34.04 
 
 		 450 aa  100  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 		 1272 aa  98.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.55 
 
 		 1042 aa  95.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 400 aa  95.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  27.51 
 
 		 513 aa  92.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.62 
 
 		 670 aa  89  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.75 
 
 		 1363 aa  85.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.44 
 
 		 403 aa  84  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.07 
 
 		 1380 aa  81.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.28 
 
 		 527 aa  79  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.67 
 
 		 1363 aa  77.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.22 
 
 		 491 aa  77.4  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 472 aa  77  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  27.84 
 
 		 771 aa  77  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.49 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.19 
 
 		 4761 aa  76.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  32.26 
 
 		 715 aa  75.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 		 598 aa  74.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.58 
 
 		 6678 aa  72.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.51 
 
 		 1973 aa  73.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.61 
 
 		 401 aa  72.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  35.52 
 
 		 841 aa  71.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  25.86 
 
 		 391 aa  70.1  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 		 585 aa  69.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  28.66 
 
 		 1299 aa  68.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  45.98 
 
 		 340 aa  68.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  48.1 
 
 		 409 aa  68.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  32.68 
 
 		 1162 aa  65.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.79 
 
 		 4357 aa  65.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  26.69 
 
 		 836 aa  64.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  29.65 
 
 		 1299 aa  64.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  37.96 
 
 		 861 aa  63.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1367 aa  63.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.46 
 
 		 598 aa  62.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2388  hypothetical protein  37.63 
 
 		 352 aa  62.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30 
 
 		 2170 aa  62.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  23.65 
 
 		 501 aa  62.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  26.45 
 
 		 696 aa  62.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.94 
 
 		 688 aa  61.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  29.02 
 
 		 252 aa  61.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  35.46 
 
 		 730 aa  61.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  35.46 
 
 		 525 aa  61.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  29.05 
 
 		 674 aa  60.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0853  hypothetical protein  36.26 
 
 		 638 aa  60.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.46012  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  29.69 
 
 		 207 aa  60.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1374 aa  59.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1931 aa  59.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 995 aa  58.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.22 
 
 		 11716 aa  58.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.11 
 
 		 599 aa  57.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.32 
 
 		 940 aa  58.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  23.27 
 
 		 2334 aa  58.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.6 
 
 		 846 aa  58.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1504 aa  57.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.95 
 
 		 864 aa  57.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.24 
 
 		 708 aa  57  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  33.59 
 
 		 853 aa  57  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  30.72 
 
 		 747 aa  57.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  30.35 
 
 		 430 aa  57  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.37 
 
 		 6885 aa  57  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.34 
 
 		 757 aa  57  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  28.49 
 
 		 981 aa  56.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.91 
 
 		 265 aa  56.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.51 
 
 		 382 aa  56.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  27.3 
 
 		 502 aa  56.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.5 
 
 		 1848 aa  56.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.6 
 
 		 1160 aa  55.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.47 
 
 		 870 aa  55.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.46 
 
 		 1679 aa  54.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  34.07 
 
 		 307 aa  54.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.71 
 
 		 9585 aa  54.3  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.93 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  24.2 
 
 		 864 aa  53.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.15 
 
 		 2447 aa  53.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  30.47 
 
 		 430 aa  53.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.36 
 
 		 288 aa  53.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  27.69 
 
 		 316 aa  52.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  28.26 
 
 		 1025 aa  53.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  40 
 
 		 1303 aa  52.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.28 
 
 		 739 aa  52.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  42.67 
 
 		 1272 aa  52  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  31.07 
 
 		 743 aa  51.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.71 
 
 		 795 aa  52  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 1424 aa  52  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.16 
 
 		 671 aa  51.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 999 aa  51.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0851  hypothetical protein  30.52 
 
 		 531 aa  51.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.913265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>