More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2609 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.5 
 
 		 603 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 598 aa  1223    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.09 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.61 
 
 		 607 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.36 
 
 		 671 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.33 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.74 
 
 		 585 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.73 
 
 		 680 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 		 599 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.03 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  35.08 
 
 		 608 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  34.84 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.3 
 
 		 555 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  35.02 
 
 		 555 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  25.16 
 
 		 756 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  25.16 
 
 		 756 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  25.16 
 
 		 756 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  36.56 
 
 		 232 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  34.3 
 
 		 225 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  31.44 
 
 		 223 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.92 
 
 		 224 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 		 224 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 		 225 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  32.56 
 
 		 224 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 		 268 aa  94  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  32.56 
 
 		 224 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.19 
 
 		 223 aa  93.6  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.19 
 
 		 223 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  29.65 
 
 		 245 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  37.42 
 
 		 220 aa  92  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.72 
 
 		 234 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.27 
 
 		 229 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  31.66 
 
 		 222 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 		 247 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  30.65 
 
 		 257 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  30.65 
 
 		 257 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  36.9 
 
 		 241 aa  90.1  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  33.18 
 
 		 230 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 		 228 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  35.12 
 
 		 248 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 		 232 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  32.23 
 
 		 236 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  32.71 
 
 		 230 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  30.64 
 
 		 227 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 		 235 aa  87.4  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 		 224 aa  87  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  31.13 
 
 		 236 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  30 
 
 		 227 aa  86.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 233 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 233 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 236 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  35.51 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  31.3 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  35.51 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  32.84 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  35.48 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  34.04 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  33.33 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  31.92 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.72 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  32.45 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  34.84 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.72 
 
 		 228 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  33.33 
 
 		 238 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  32.34 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 		 230 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  34.04 
 
 		 225 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  31.05 
 
 		 235 aa  83.2  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  32.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  32.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.72 
 
 		 228 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.01 
 
 		 231 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.45 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  31.41 
 
 		 233 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  31.37 
 
 		 234 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.41 
 
 		 233 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  32.98 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.97 
 
 		 229 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  40.87 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.03 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>