22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2255 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 1374 aa  2753    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1973  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 934 aa  178  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  27.24 
 
 		 676 aa  89.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1576 aa  73.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  20.88 
 
 		 6678 aa  62.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1101 aa  62  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.14 
 
 		 4433 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  32.6 
 
 		 736 aa  58.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.19 
 
 		 4357 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  28.32 
 
 		 429 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  29.44 
 
 		 728 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  43.94 
 
 		 245 aa  49.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  23.19 
 
 		 1279 aa  49.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8811  hypothetical protein  34.52 
 
 		 389 aa  48.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1504 aa  48.5  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.76 
 
 		 1013 aa  48.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.6 
 
 		 4761 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  32.59 
 
 		 739 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  36.55 
 
 		 2821 aa  47.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1766 aa  46.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  46.15 
 
 		 639 aa  46.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 946 aa  45.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>