24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3035 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1306    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  37.66 
 
 		 1159 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.34 
 
 		 2313 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0050  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.0205198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0060  FHA domain-containing protein  41.79 
 
 		 331 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0069  FHA domain-containing protein  41.79 
 
 		 331 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  0.054766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 848 aa  50.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  27.4 
 
 		 1951 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  23.37 
 
 		 2764 aa  50.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.18 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  23.76 
 
 		 692 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2382  hypothetical protein  25.45 
 
 		 270 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000742969  hitchhiker  0.00107532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3236  hypothetical protein  31 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1884  hypothetical protein  24.32 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000419061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1528  hypothetical protein  24.55 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000725408  hitchhiker  0.0000459629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1279 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3039  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1892 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01628  hypothetical protein  24.32 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01638  hypothetical protein  24.32 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0282  hypothetical protein  21.95 
 
 		 303 aa  44.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1973  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 254 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00561956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1869  hypothetical protein  25.47 
 
 		 270 aa  44.3  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1962  hypothetical protein  24.55 
 
 		 254 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>