215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03668 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  100 
 
 		 692 aa  1341    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.18 
 
 		 1279 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.85 
 
 		 1480 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.78 
 
 		 1156 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.65 
 
 		 1217 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  28.72 
 
 		 1383 aa  117  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.42 
 
 		 2954 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  30.33 
 
 		 999 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 946 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.85 
 
 		 1363 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  36.78 
 
 		 589 aa  107  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.02 
 
 		 1534 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  30 
 
 		 2667 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  38.41 
 
 		 1532 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.3 
 
 		 728 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  30.83 
 
 		 387 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.47 
 
 		 4798 aa  94  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  29.09 
 
 		 15831 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  27.23 
 
 		 739 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  28.87 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.3 
 
 		 14829 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.27 
 
 		 4334 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  31.09 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.26 
 
 		 2775 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 1236 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 		 1286 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 2107 aa  77.8  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  32.17 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  28.93 
 
 		 833 aa  77.4  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  33.52 
 
 		 245 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  26.2 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  27.01 
 
 		 742 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  28.38 
 
 		 2105 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 1789 aa  74.3  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 		 3954 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1424 aa  74.3  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  29.75 
 
 		 724 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.39 
 
 		 2245 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  26.67 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 980 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.78 
 
 		 855 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.51 
 
 		 950 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  25.82 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  29.25 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  25.86 
 
 		 2648 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  38.17 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  28.79 
 
 		 1164 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  26.09 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 1795 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 		 1287 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.07 
 
 		 3427 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  30.68 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 		 1895 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  37.09 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  30.43 
 
 		 2145 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  25.39 
 
 		 4723 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.8 
 
 		 965 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.6 
 
 		 2689 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.51 
 
 		 1400 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 2885 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  30.22 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.5 
 
 		 1712 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  30.99 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.35 
 
 		 3608 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.78 
 
 		 1883 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  30.16 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  32.41 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  25.28 
 
 		 4687 aa  63.9  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 		 1963 aa  63.9  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  27.82 
 
 		 3587 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.03 
 
 		 2668 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.77 
 
 		 9867 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  30.08 
 
 		 680 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  41.9 
 
 		 2178 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  32.23 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 		 1855 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  32.41 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  35.62 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  28.73 
 
 		 1572 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  32.7 
 
 		 610 aa  62  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  27.18 
 
 		 959 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.1 
 
 		 36805 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  27.92 
 
 		 3587 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.31 
 
 		 4800 aa  61.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.65 
 
 		 3619 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  26.12 
 
 		 1112 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  32.42 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  28.68 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.32 
 
 		 3619 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  28.38 
 
 		 1043 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.33 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  32.67 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.28 
 
 		 813 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  23.65 
 
 		 12741 aa  57.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>