52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1488 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  98.22 
 
 		 852 aa  1587    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  90.97 
 
 		 1107 aa  1944    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  100 
 
 		 1951 aa  3860    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  38.61 
 
 		 1923 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  41.88 
 
 		 1984 aa  1101    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  40.04 
 
 		 1941 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  41.86 
 
 		 1940 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  42.94 
 
 		 1982 aa  1151    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.78 
 
 		 2370 aa  100  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.76 
 
 		 2216 aa  97.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.22 
 
 		 2225 aa  82.8  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.89 
 
 		 2065 aa  79  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  23.16 
 
 		 2276 aa  75.5  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.86 
 
 		 2739 aa  74.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  22.76 
 
 		 2091 aa  73.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0966  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.36 
 
 		 2844 aa  71.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.84 
 
 		 2596 aa  70.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.88 
 
 		 2209 aa  69.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24 
 
 		 2407 aa  68.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.97 
 
 		 2267 aa  67.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.62 
 
 		 2437 aa  66.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.8 
 
 		 2123 aa  66.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.07 
 
 		 2435 aa  65.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.19 
 
 		 2270 aa  64.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.47 
 
 		 2114 aa  63.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.39 
 
 		 2800 aa  63.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.43 
 
 		 2760 aa  62.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 2786 aa  61.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0988  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.66 
 
 		 2270 aa  61.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.37 
 
 		 2237 aa  61.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 2083 aa  60.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.89 
 
 		 2655 aa  59.3  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 		 2305 aa  59.3  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.91 
 
 		 1251 aa  58.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.16 
 
 		 2756 aa  58.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.61 
 
 		 2210 aa  57  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.75 
 
 		 2747 aa  56.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 1369 aa  55.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.59 
 
 		 1256 aa  53.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0561  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 		 2280 aa  53.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0319  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.12 
 
 		 2139 aa  52.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.69 
 
 		 2263 aa  51.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.93 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0960  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.9 
 
 		 2236 aa  49.3  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  27.4 
 
 		 676 aa  48.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0967  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.69 
 
 		 2266 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3391  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.29 
 
 		 2788 aa  47.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.54 
 
 		 2321 aa  47.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.45 
 
 		 2751 aa  47.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.15 
 
 		 1519 aa  46.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.21 
 
 		 1333 aa  46.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  20.15 
 
 		 2656 aa  45.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>