49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3676 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  53.11 
 
 		 1107 aa  968    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  42.71 
 
 		 1951 aa  1144    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  40.96 
 
 		 1984 aa  1206    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  69.74 
 
 		 1941 aa  2476    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  100 
 
 		 1940 aa  3811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  76.52 
 
 		 1982 aa  2863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  69.04 
 
 		 1923 aa  2439    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 852 aa  199  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  62.6 
 
 		 3322 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.7 
 
 		 2065 aa  78.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.39 
 
 		 2216 aa  77  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  35.11 
 
 		 631 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.54 
 
 		 2225 aa  71.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  23.56 
 
 		 2276 aa  70.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  23.66 
 
 		 2656 aa  68.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  22.87 
 
 		 2091 aa  66.6  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0966  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.36 
 
 		 2844 aa  66.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.64 
 
 		 1251 aa  64.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.68 
 
 		 2370 aa  64.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0592  hypothetical protein  34.57 
 
 		 379 aa  63.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0273553 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.43 
 
 		 2270 aa  63.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.89 
 
 		 2739 aa  63.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.89 
 
 		 2210 aa  61.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.12 
 
 		 2114 aa  61.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 		 2083 aa  60.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.16 
 
 		 2209 aa  59.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.31 
 
 		 1464 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.23 
 
 		 2123 aa  56.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.54 
 
 		 2263 aa  55.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.18 
 
 		 2267 aa  55.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.89 
 
 		 1256 aa  55.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.07 
 
 		 2655 aa  55.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.87 
 
 		 2407 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.74 
 
 		 2596 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.25 
 
 		 2760 aa  53.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.24 
 
 		 2747 aa  53.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.12 
 
 		 2237 aa  52  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  35.2 
 
 		 478 aa  52  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.35 
 
 		 2437 aa  50.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.24 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.66 
 
 		 2310 aa  50.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.76 
 
 		 2756 aa  50.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.28 
 
 		 2435 aa  49.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1032  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.37 
 
 		 561 aa  48.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.983236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.86 
 
 		 2786 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3371  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.78 
 
 		 2245 aa  47  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.99 
 
 		 2321 aa  46.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  61.22 
 
 		 2057 aa  46.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.76 
 
 		 2305 aa  45.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>