20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2244 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  98.22 
 
 		 1951 aa  1590    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  33.09 
 
 		 1984 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  29.25 
 
 		 1923 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  31.07 
 
 		 1941 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  31.35 
 
 		 1940 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  31.35 
 
 		 1982 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3371  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.12 
 
 		 2245 aa  59.3  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.33 
 
 		 1369 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0319  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.59 
 
 		 2139 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0967  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.13 
 
 		 2266 aa  51.2  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0960  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.9 
 
 		 2236 aa  48.9  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.38 
 
 		 2370 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.1 
 
 		 2407 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.96 
 
 		 2065 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.11 
 
 		 1464 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.91 
 
 		 2435 aa  45.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 2800 aa  45.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.16 
 
 		 2114 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.56 
 
 		 1333 aa  44.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>