42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3847 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  46.76 
 
 		 1107 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  100 
 
 		 1923 aa  3768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  77.01 
 
 		 1982 aa  2779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  68.77 
 
 		 1940 aa  2448    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  40 
 
 		 1951 aa  992    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  98.25 
 
 		 1941 aa  3701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  50.19 
 
 		 1984 aa  1721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 		 852 aa  207  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  62.39 
 
 		 3322 aa  115  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.66 
 
 		 2114 aa  85.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  24.87 
 
 		 2276 aa  84.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  23.67 
 
 		 2091 aa  76.3  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.94 
 
 		 2216 aa  75.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.77 
 
 		 2065 aa  70.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.68 
 
 		 1251 aa  70.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 2083 aa  61.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  35.9 
 
 		 631 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 		 2267 aa  59.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 2210 aa  58.9  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.49 
 
 		 1464 aa  58.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.17 
 
 		 2760 aa  58.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.54 
 
 		 2237 aa  56.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.23 
 
 		 2263 aa  55.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.34 
 
 		 2225 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.51 
 
 		 2370 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.93 
 
 		 2270 aa  54.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0983  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.14 
 
 		 2309 aa  53.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.98 
 
 		 2209 aa  52.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.17 
 
 		 2596 aa  52  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.33 
 
 		 2655 aa  51.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.26 
 
 		 2739 aa  51.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.49 
 
 		 2321 aa  49.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.55 
 
 		 2407 aa  48.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  37.04 
 
 		 478 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.22 
 
 		 2747 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.91 
 
 		 2310 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.05 
 
 		 2751 aa  47.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.49 
 
 		 2435 aa  48.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.19 
 
 		 1256 aa  47  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 994 aa  46.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.51 
 
 		 2305 aa  45.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.33 
 
 		 2756 aa  45.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>