51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3802 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 2083 aa  3979    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.65 
 
 		 1489 aa  67.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 		 2848 aa  68.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.27 
 
 		 1369 aa  67.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  24.51 
 
 		 2407 aa  66.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  28.81 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  24.05 
 
 		 994 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  29.25 
 
 		 1769 aa  65.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 		 980 aa  64.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  24.35 
 
 		 3506 aa  62.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.87 
 
 		 2711 aa  62  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  28.89 
 
 		 1923 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  30.34 
 
 		 1951 aa  60.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  26.14 
 
 		 1152 aa  60.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  28.16 
 
 		 1940 aa  60.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.37 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  30.34 
 
 		 1107 aa  59.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  28.33 
 
 		 1982 aa  59.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  23.05 
 
 		 1016 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.1 
 
 		 985 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 1459 aa  58.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  28.33 
 
 		 1941 aa  57.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  26.58 
 
 		 1458 aa  58.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  26.06 
 
 		 1222 aa  57  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  29.78 
 
 		 1984 aa  57  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.55 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.69 
 
 		 1242 aa  55.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.29 
 
 		 1055 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.18 
 
 		 1251 aa  54.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  25.71 
 
 		 1038 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.53 
 
 		 1322 aa  52.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.38 
 
 		 1673 aa  52.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.35 
 
 		 2210 aa  52  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  22.92 
 
 		 814 aa  52  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.22 
 
 		 2596 aa  50.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.58 
 
 		 2225 aa  50.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  24.03 
 
 		 1130 aa  50.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.79 
 
 		 1782 aa  50.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.64 
 
 		 1848 aa  50.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.97 
 
 		 2370 aa  50.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  24.68 
 
 		 907 aa  49.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  24.62 
 
 		 1672 aa  47.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.2 
 
 		 919 aa  47  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 3152 aa  47.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  27.03 
 
 		 1550 aa  47.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.69 
 
 		 983 aa  47.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.6 
 
 		 972 aa  47  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  23.49 
 
 		 939 aa  46.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  23.56 
 
 		 990 aa  46.2  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.58 
 
 		 3705 aa  46.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.1 
 
 		 1119 aa  46.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>