52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3678 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  75.91 
 
 
1923 aa  2753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  100 
 
 
1982 aa  3879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  54.45 
 
 
1107 aa  997    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  76.52 
 
 
1940 aa  2835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  76.51 
 
 
1941 aa  2783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  41.6 
 
 
1984 aa  1218    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.209421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2244  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 
852 aa  208  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  66.37 
 
 
3322 aa  129  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 
2065 aa  81.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  34.8 
 
 
631 aa  80.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.16 
 
 
2216 aa  75.9  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.26 
 
 
2596 aa  69.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.83 
 
 
1251 aa  67  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.91 
 
 
2209 aa  67  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.72 
 
 
2370 aa  65.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.56 
 
 
2114 aa  65.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  22.93 
 
 
2656 aa  65.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  32.61 
 
 
1951 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  23.75 
 
 
2276 aa  63.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
1464 aa  61.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.48 
 
 
2739 aa  60.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.91 
 
 
2225 aa  60.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 
2083 aa  59.3  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.06 
 
 
2760 aa  59.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.49 
 
 
2655 aa  58.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 
2123 aa  58.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.85 
 
 
1256 aa  57  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.54 
 
 
2210 aa  56.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.06 
 
 
2237 aa  55.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  23.31 
 
 
2091 aa  54.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.54 
 
 
1048 aa  53.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.06 
 
 
2747 aa  53.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.78 
 
 
2270 aa  52  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.6 
 
 
2267 aa  50.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.96 
 
 
826 aa  51.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  34.4 
 
 
478 aa  50.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.29 
 
 
2437 aa  50.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.12 
 
 
2786 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.98 
 
 
2800 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0967  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.03 
 
 
2266 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.54 
 
 
2305 aa  48.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.8 
 
 
2407 aa  48.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  63.27 
 
 
2057 aa  47.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0960  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.54 
 
 
2236 aa  47.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.69 
 
 
2310 aa  47.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.88 
 
 
2435 aa  46.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.19 
 
 
2751 aa  46.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 
994 aa  46.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 
2321 aa  46.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  23.5 
 
 
985 aa  45.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0983  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.04 
 
 
2309 aa  45.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6421  hypothetical protein  40.37 
 
 
547 aa  45.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>