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for query gene Huta_1032 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1032  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 
561 aa  1109    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.983236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0998  Sec-independent periplasmic protein translocase  52.42 
 
 
598 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2609  Sec-independent periplasmic protein translocase  46.41 
 
 
360 aa  307  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116884  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2051  Sec-independent periplasmic protein translocase  51.34 
 
 
381 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0168  Sec-independent periplasmic protein translocase  45.58 
 
 
324 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2547  sec-independent protein translocase, protein  29.08 
 
 
260 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  30.05 
 
 
266 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.94 
 
 
277 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  27.56 
 
 
285 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.03 
 
 
398 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  25.2 
 
 
262 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  28.87 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.34 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.92 
 
 
250 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  25.91 
 
 
247 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  25.96 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.42 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.01 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  28.03 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.77 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  25 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  25.79 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.15 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.02 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  26.1 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.75 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.02 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.36 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.15 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  26.98 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.2 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.29 
 
 
253 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  24.33 
 
 
266 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  25.17 
 
 
264 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.85 
 
 
264 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  26.58 
 
 
255 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  26.42 
 
 
267 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.34 
 
 
253 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  23.89 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.34 
 
 
253 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1486  MttB family protein  26.4 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.96 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  23.39 
 
 
261 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.96 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.96 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.21 
 
 
316 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.96 
 
 
251 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  23.95 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.91 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.64 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  27.78 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  23.39 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  26.09 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  23.39 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.92 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.09 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.92 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  25.79 
 
 
250 aa  69.7  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.85 
 
 
247 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  26.09 
 
 
247 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  23.39 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  25.69 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  25.69 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  25.69 
 
 
247 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  24.4 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.11 
 
 
246 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.3 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.51 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.69 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  25.69 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.39 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  27.45 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.24 
 
 
258 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  26.44 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.41 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.88 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.97 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.6 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  24.4 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.83 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  28.44 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  30.33 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.18 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.69 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  25 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0716  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.75 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  27.68 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.68 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.33 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
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NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.58 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  22.98 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  26.05 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
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