More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2547 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2547  sec-independent protein translocase, protein  100 
 
 
260 aa  517  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2609  Sec-independent periplasmic protein translocase  33.33 
 
 
360 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116884  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0998  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.43 
 
 
598 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0168  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.67 
 
 
324 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2051  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.83 
 
 
381 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1032  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.08 
 
 
561 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.983236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  32.05 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  31.51 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.43 
 
 
247 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.25 
 
 
262 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30.25 
 
 
262 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  32.76 
 
 
271 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.25 
 
 
262 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.17 
 
 
247 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.8 
 
 
260 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.78 
 
 
246 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  31.58 
 
 
268 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.58 
 
 
268 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
261 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
261 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  30.61 
 
 
262 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  28.7 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.02 
 
 
251 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  28.7 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.4 
 
 
248 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  28.7 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  28.7 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  28.7 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  31.49 
 
 
265 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  29.96 
 
 
250 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.64 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  29.57 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.75 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.55 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  28.89 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  27.83 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  28.44 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.37 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3098  TatCD protein  28.83 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000196448  hitchhiker  5.70028e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.77 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.76 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  32.77 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.88 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.74 
 
 
398 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  29.22 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  30.3 
 
 
230 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.36 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  30.52 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2546  sec-independent protein translocase, protein  30.04 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0790015  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.82 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.49 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.87 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.14 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.53 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  29.46 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  29.75 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.87 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.8 
 
 
274 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
324 aa  95.9  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.42 
 
 
280 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  33.78 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.65 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.08 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.21 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.91 
 
 
468 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.3 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.7 
 
 
241 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.86 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.22 
 
 
256 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.09 
 
 
269 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.82 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.59 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  26.96 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.74 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  27.43 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  27.71 
 
 
245 aa  92.8  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  29.15 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.91 
 
 
289 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  28.91 
 
 
289 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.92 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.29 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.51 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  29.88 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  28.93 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  30.43 
 
 
274 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.35 
 
 
275 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.43 
 
 
274 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.35 
 
 
264 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  27.27 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.72 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>