More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0417 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  97.71 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  93.1 
 
 		 261 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  93.1 
 
 		 261 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  94.74 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  84.67 
 
 		 259 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  85.33 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  84.94 
 
 		 259 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  88.76 
 
 		 260 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  87.31 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  88.63 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.18 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  69.02 
 
 		 260 aa  348  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.65 
 
 		 258 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2940  putative SEC-independent translocase protein TATC transmembrane  68.36 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3217  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.65 
 
 		 267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.920211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.65 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0371703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3098  Sec-independent protein translocase TatC  69.47 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.923548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  56.73 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  60.17 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.68 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.21 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  52.61 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.21 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  55.46 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.05 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  52.02 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  51.61 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.8 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  52.03 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  49.19 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.64 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.02 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  51.63 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  52.3 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.43 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.16 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50.59 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  51.91 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  52.63 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  49.18 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50.42 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.61 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  50 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.62 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.26 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.63 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  51.45 
 
 		 267 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  51.82 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  51.04 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  51.56 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  48.64 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.24 
 
 		 262 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.24 
 
 		 262 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  48.43 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  47.43 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.17 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  47.04 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  45.02 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  51.2 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  51 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  54.47 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  48.98 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  45.88 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  51.04 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  48.98 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  47.77 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  48.58 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  48.98 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  48.44 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.6 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  50.23 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.33 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  49.2 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.81 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  48.1 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  46.06 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>