More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0318 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  69.08 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  67.49 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  67.08 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  66.67 
 
 		 249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.43 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.12 
 
 		 251 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.12 
 
 		 251 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.12 
 
 		 251 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.12 
 
 		 251 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.11 
 
 		 248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.97 
 
 		 253 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  62.5 
 
 		 249 aa  341  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.57 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  63.82 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.45 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.82 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.52 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.85 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.46 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.13 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.2 
 
 		 249 aa  332  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  63.87 
 
 		 250 aa  331  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  65.24 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  61.6 
 
 		 252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  64.52 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.09 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  64.61 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  64.61 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  59.69 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  66.26 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  64.2 
 
 		 258 aa  321  9.000000000000001e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  65.32 
 
 		 250 aa  318  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  64.61 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  64.61 
 
 		 245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  63.87 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.91 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  58.89 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  55.04 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  54.65 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  58.13 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.56 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.73 
 
 		 368 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  54.65 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.09 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  53.7 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  53.97 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  55.02 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.57 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  54.03 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  54.69 
 
 		 265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.76 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.33 
 
 		 262 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.33 
 
 		 262 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.36 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  56.77 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  57.34 
 
 		 254 aa  274  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.19 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.3 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.88 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.22 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  54.75 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.42 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.92 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.72 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.38 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.38 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.27 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.12 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  51.58 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.43 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  49.43 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.43 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.4 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  47.37 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  51.42 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.81 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  46.25 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  46.74 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  48.05 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>