More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2427 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  90 
 
 
249 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  90.38 
 
 
250 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  76 
 
 
251 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  68.15 
 
 
253 aa  362  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  69.42 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  70.49 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.46 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.46 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.46 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.46 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.46 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.4 
 
 
258 aa  353  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  68.42 
 
 
250 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  69.35 
 
 
255 aa  351  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  64.9 
 
 
261 aa  349  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  64.78 
 
 
249 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  64.78 
 
 
249 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  63.56 
 
 
249 aa  345  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.16 
 
 
251 aa  345  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  68.15 
 
 
258 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  68.15 
 
 
258 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.16 
 
 
248 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  67.74 
 
 
258 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  69.79 
 
 
256 aa  341  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.35 
 
 
251 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.35 
 
 
251 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.35 
 
 
251 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.94 
 
 
251 aa  340  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.68 
 
 
253 aa  339  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.35 
 
 
249 aa  339  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.25 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.53 
 
 
255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  69.26 
 
 
245 aa  332  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.45 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  60.4 
 
 
252 aa  318  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  61.54 
 
 
251 aa  319  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  65.59 
 
 
249 aa  317  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  60.57 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.63 
 
 
269 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  63.75 
 
 
255 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  62.4 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  59.13 
 
 
266 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.92 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.92 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  58.33 
 
 
266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.35 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  61.6 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.04 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  62.45 
 
 
250 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  59.51 
 
 
267 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  59.51 
 
 
267 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  62.56 
 
 
254 aa  298  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  56.85 
 
 
257 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  63.04 
 
 
262 aa  295  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.91 
 
 
398 aa  293  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.26 
 
 
256 aa  291  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.58 
 
 
368 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.09 
 
 
264 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  58.26 
 
 
265 aa  284  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  58.15 
 
 
368 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.9 
 
 
258 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  53.31 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.94 
 
 
253 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.53 
 
 
253 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.94 
 
 
253 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.89 
 
 
252 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.83 
 
 
264 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  51.22 
 
 
244 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  51.95 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.57 
 
 
265 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.55 
 
 
259 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  51.91 
 
 
278 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  50.2 
 
 
294 aa  247  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.42 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.42 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.2 
 
 
262 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  50.2 
 
 
262 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.62 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.62 
 
 
277 aa  239  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.18 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.07 
 
 
249 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 
262 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  47.97 
 
 
260 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  48.03 
 
 
262 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.03 
 
 
262 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.03 
 
 
262 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.18 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
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NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  50 
 
 
251 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  47.88 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 
259 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
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